Hierarchy For All Packages

Package Hierarchies:

• edu.claflin.finder,
• edu.claflin.finder.algo,
• edu.claflin.finder.io,
• edu.claflin.finder.io.graph,
• edu.claflin.finder.io.graph.sub,
• edu.claflin.finder.log,
• edu.claflin.finder.logic,
• edu.claflin.finder.logic.comp,
• edu.claflin.finder.logic.cond,
• edu.claflin.finder.logic.cygrouper,
• edu.claflin.finder.logic.processor

Class Hierarchy

• java.lang.Object
  • java.util.AbstractCollection<E> (implements java.util.Collection<E>)
    • java.util.AbstractQueue<E> (implements java.util.Queue<E>)
      • java.util.PriorityQueue<E> (implements java.io.Serializable)
        • edu.claflin.finder.logic.PrioritySet<T>
  • edu.claflin.finder.algo.Algorithm (implements edu.claflin.finder.logic.processor.Processable<T,S>)
    • edu.claflin.finder.algo.BreadthFirstTraversalSearch
    • edu.claflin.finder.algo.Bundle (implements java.beans.PropertyChangeListener)
    • edu.claflin.finder.algo.DepthFirstTraversalSearch
    • edu.claflin.finder.algo.MatrixPatternAnalyzer
  • edu.claflin.finder.algo.ArgumentsBundle
  • edu.claflin.finder.logic.processor.BatchProcessor<T,S>
  • edu.claflin.finder.logic.cygrouper.Communicator (implements edu.claflin.finder.logic.cygrouper.CommunicationListener)
  • edu.claflin.finder.logic.Condition
    • edu.claflin.finder.logic.cond.BipartiteCondition
    • edu.claflin.finder.logic.cond.CliqueCondition
    • edu.claflin.finder.logic.cond.DirectedCliqueCondition
  • edu.claflin.finder.logic.cygrouper.CygrouperAssembler
  • edu.claflin.finder.logic.cygrouper.CygrouperEdge
  • edu.claflin.finder.logic.cygrouper.CygrouperNode
  • edu.claflin.finder.logic.cygrouper.CytogrouperMain
  • edu.claflin.finder.logic.Edge<D>
  • edu.claflin.finder.logic.comp.EdgeWeightComparator (implements java.util.Comparator<T>)
  • edu.claflin.finder.Global
  • edu.claflin.finder.logic.Graph
    • edu.claflin.finder.logic.ConditionedGraph
  • edu.claflin.finder.log.LogUtil
  • edu.claflin.finder.Main
  • edu.claflin.finder.io.ManifestParser
  • edu.claflin.finder.io.graph.NOABatchIO (implements edu.claflin.finder.io.graph.sub.GraphWriter)
  • edu.claflin.finder.logic.Node
  • edu.claflin.finder.io.graph.SIFGraphIO (implements edu.claflin.finder.io.graph.sub.GraphReader, edu.claflin.finder.io.graph.sub.GraphWriter)
  • edu.claflin.finder.io.graph.SimpleGraphIO (implements edu.claflin.finder.io.graph.sub.GraphReader, edu.claflin.finder.io.graph.sub.GraphWriter)

Interface Hierarchy

• edu.claflin.finder.logic.cygrouper.CommunicationListener
• edu.claflin.finder.io.graph.sub.GraphReader
• edu.claflin.finder.io.graph.sub.GraphWriter
• edu.claflin.finder.logic.processor.Processable<T,S>

Enum Hierarchy

• java.lang.Object
  • java.lang.Enum<E> (implements java.lang.Comparable<T>, java.io.Serializable)
    • edu.claflin.finder.algo.ArgumentsBundle.COMMON_ARGS
    • edu.claflin.finder.log.LogLevel
    • edu.claflin.finder.log.LogType